138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1502 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  50.54 
 
 
180 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  47.27 
 
 
160 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  47.27 
 
 
160 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  56.31 
 
 
168 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  41.21 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  55.75 
 
 
219 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  58.59 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  44.77 
 
 
168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  43.02 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  51.69 
 
 
152 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 
149 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  53 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  41.04 
 
 
141 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
141 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  51.55 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  29.14 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  26.97 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  26.58 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  23.67 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  26.9 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  30.1 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  26.97 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  27.12 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  24.11 
 
 
141 aa  48.5  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  29.36 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  30.19 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  27.43 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  22.81 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  31.19 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  22.35 
 
 
172 aa  47.8  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  29.91 
 
 
135 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  25.47 
 
 
125 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  25.47 
 
 
125 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  21.76 
 
 
169 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  25.15 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  26 
 
 
134 aa  47.4  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  21.76 
 
 
170 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  29.91 
 
 
135 aa  47.4  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  26.14 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  31.13 
 
 
164 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  26.92 
 
 
140 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  30.48 
 
 
135 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  25 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  26.52 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  27.62 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  24.44 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  24.71 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  27.62 
 
 
206 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  30.19 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  24.51 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  24 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  28.07 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  24.78 
 
 
209 aa  45.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  26.92 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  31.37 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  25.25 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  27 
 
 
224 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  32.32 
 
 
163 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  25.86 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4671  single-strand binding protein  29.81 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.726649  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  26.17 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  31.07 
 
 
121 aa  44.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  26.59 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  25.14 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  22.81 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  24.32 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  27.62 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  24.73 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  29.63 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 
111 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  24.02 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  24.02 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  24.02 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  30.48 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  24.02 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  21.01 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  21.89 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  28.37 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  27.36 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  28.04 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  24.02 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  24.02 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  28.16 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  27.78 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  27.78 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  29.13 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  23.67 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  24.79 
 
 
133 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.7 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  22.41 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  27.45 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  23.46 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  25.96 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  24.31 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  23.85 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  27.78 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 
111 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>