50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_05591 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 141 aa  290  5e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  92.2 
 
 		 141 aa  271  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  86.52 
 
 		 141 aa  261  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  71.14 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  45.27 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  43.92 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  41.45 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  40.62 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  49 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  46.61 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  46.61 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  44 
 
 		 181 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  43.43 
 
 		 219 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  41 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  42.57 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  22.96 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  25.95 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  23.97 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  28.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  24 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  25.42 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1650  single-strand binding protein  22.69 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  24.49 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  23.76 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  21.9 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  23.76 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  24.35 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  25.96 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  24.22 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  24.76 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  23.4 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  22.7 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  22.33 
 
 		 133 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  26.09 
 
 		 164 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  21.38 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  22.6 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  25.93 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  21.7 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  20 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  25.49 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  22.77 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  26.61 
 
 		 275 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>