130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2913 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  100 
 
 		 160 aa  330  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  100 
 
 		 160 aa  330  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  48.09 
 
 		 219 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  48.48 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  45.86 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  54.95 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  51.92 
 
 		 181 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  39.51 
 
 		 148 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  40.4 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  39.74 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  42.07 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  37.87 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  39.38 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  48.48 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  38.69 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  33.58 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  27.46 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  28.99 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  28.74 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  26.38 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  27.33 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  33.03 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  27.11 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  26.35 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  26.21 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  26.95 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  25.36 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  29.25 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  25.77 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  23.67 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  24.7 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  24.85 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  26.52 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  23.67 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  25 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  25.25 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2461  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  33.66 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  27.08 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  25.69 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  24.56 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  25.24 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  26.21 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  26.09 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  25.84 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  26.35 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3562  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.33 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  25.96 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  25.73 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  25.15 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  23.12 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  23.84 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  23.12 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  26.19 
 
 		 206 aa  44.3  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  30.34 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  27.38 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  25 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  25 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  26.79 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  27.62 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  26.44 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  26.44 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>