271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3562 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014214  Mesil_3562  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  43.26 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  40.47 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2840  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2524  single-strand binding protein  31.6 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000823265  normal  0.0673427 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2964  single-strand binding protein  33.79 
 
 		 283 aa  75.1  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  41.24 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2969  single-strand binding protein  29.49 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  37.5 
 
 		 110 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.17 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  37.14 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  35.65 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  38.14 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 161 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 172 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 140 aa  52.8  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  29.9 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  33.83 
 
 		 132 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 148 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 182 aa  52  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 166 aa  52  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  35.24 
 
 		 161 aa  52  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  35.64 
 
 		 176 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  34.86 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  35 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  35 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  31 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  33.98 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 167 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  34.51 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 146 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 151 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  37.62 
 
 		 167 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  37.62 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  34.69 
 
 		 158 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 161 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 161 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  35 
 
 		 147 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  34 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  31.19 
 
 		 173 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  34 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 183 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  35.35 
 
 		 166 aa  48.5  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 171 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 164 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 183 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  25 
 
 		 152 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  32 
 
 		 114 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  32 
 
 		 114 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  37.62 
 
 		 167 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 173 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  29.03 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1793  single-strand DNA binding protein  33.64 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  34.29 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  34.34 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  31 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  32.38 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2200  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338329  normal  0.513026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  36 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  31.68 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>