48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0503 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  290  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  86.52 
 
 		 141 aa  261  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  85.11 
 
 		 141 aa  255  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  70.47 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  45.96 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  45.52 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  44.83 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  42.76 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  39.88 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  40.24 
 
 		 160 aa  133  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  43.71 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  53 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  50.51 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  50.51 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  43.43 
 
 		 219 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  44.44 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  41 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  41.58 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  26.54 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  24.14 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  23.26 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1650  single-strand binding protein  23.68 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  24.49 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  25.98 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  25.81 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  22.77 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  22.07 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  23.89 
 
 		 125 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  23.89 
 
 		 125 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 161 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  23 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  25.34 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  22.77 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  25.3 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  20.95 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  22.77 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  24.05 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  22.38 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  20.41 
 
 		 141 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>