27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0526 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  100 
 
 
219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  62.39 
 
 
160 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  62.39 
 
 
160 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  53.66 
 
 
165 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  39.3 
 
 
180 aa  124  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  51.52 
 
 
181 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  47.12 
 
 
168 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
149 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  40.17 
 
 
152 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  39.19 
 
 
160 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  43.43 
 
 
141 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  43.43 
 
 
141 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  42.42 
 
 
141 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  43.43 
 
 
168 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  39.39 
 
 
148 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  38.79 
 
 
153 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 
145 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  26.77 
 
 
150 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  24.76 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  24.51 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  27.18 
 
 
139 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  23.58 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  26.25 
 
 
125 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  26.25 
 
 
125 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  23.58 
 
 
140 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  27.88 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>