82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3883 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  52.88 
 
 
180 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  58.59 
 
 
165 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  51.43 
 
 
160 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  51.43 
 
 
160 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  50 
 
 
219 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  53 
 
 
168 aa  111  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  45.38 
 
 
152 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  40.66 
 
 
168 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 
160 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  36.57 
 
 
141 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  45 
 
 
141 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  44.44 
 
 
141 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  31.32 
 
 
153 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 
149 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  36.5 
 
 
148 aa  95.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 
145 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  31.87 
 
 
145 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  25.21 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  24.34 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  29.7 
 
 
176 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  29.81 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  28.97 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  29.59 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  29.59 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  29.13 
 
 
140 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  24.07 
 
 
146 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  22.34 
 
 
166 aa  48.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  26.06 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  32.32 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  24.24 
 
 
140 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  25 
 
 
156 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  22.77 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  25.74 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  22.61 
 
 
135 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  30.95 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  27.15 
 
 
301 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  22.64 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  27.43 
 
 
188 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  23.76 
 
 
135 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  23.76 
 
 
135 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  24 
 
 
150 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  28.43 
 
 
142 aa  44.7  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  26.53 
 
 
198 aa  44.7  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  27.27 
 
 
171 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  28.3 
 
 
175 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  24 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  22.81 
 
 
148 aa  44.3  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  31.11 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  28.71 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  23.4 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  27.55 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  23.81 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  23.81 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  27.55 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  21.58 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  23.28 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  29.41 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  27.55 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  26.87 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  27.72 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  29.59 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  27.72 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  27.72 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  24.53 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  27.72 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  23.62 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  25.23 
 
 
172 aa  42  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  23.58 
 
 
163 aa  42  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  25.74 
 
 
193 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  25.74 
 
 
192 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  26.67 
 
 
151 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  27.03 
 
 
148 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  20.59 
 
 
136 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  30 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  23.47 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  29.59 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  25.74 
 
 
175 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  26.53 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  26.67 
 
 
200 aa  41.2  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  27.55 
 
 
170 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>