33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05601 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  94.48 
 
 		 145 aa  286  8e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  63.4 
 
 		 153 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  55.62 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  55.26 
 
 		 152 aa  173  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  51.79 
 
 		 168 aa  171  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  46.31 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  45.27 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  44.83 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  43.92 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  40.27 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  44.12 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 180 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  43.3 
 
 		 181 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.14 
 
 		 219 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  27.15 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  26.8 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  25 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  25.19 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  24.07 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  23.15 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  27.47 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  24.51 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  25.64 
 
 		 156 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  27.66 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  24.49 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  24.42 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  24.42 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  27.63 
 
 		 193 aa  40.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>