50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1229 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  44.44 
 
 		 465 aa  161  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  42.68 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  35.83 
 
 		 299 aa  104  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  38.51 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.49 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  41.5 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  34.69 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  50 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  35.56 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  30.77 
 
 		 484 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  34.31 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  37.04 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  30.13 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  23.38 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  26.54 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  30.83 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  32.77 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  26.9 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  35.34 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0836  hypothetical protein  27.27 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  34.06 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  28.97 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0821  hypothetical protein  31.16 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  37.23 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  30.66 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  36.54 
 
 		 306 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  28.47 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  28.92 
 
 		 397 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0808  lipoprotein LpqB  30.52 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  27.01 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  28 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.76 
 
 		 383 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  30.33 
 
 		 390 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  28.18 
 
 		 514 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  32.77 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0518  hypothetical protein  32.43 
 
 		 248 aa  48.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  31.82 
 
 		 545 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  29.32 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  38.81 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  24.19 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  30 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  30 
 
 		 543 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2097  hypothetical protein  29.23 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  33.71 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1825  hypothetical protein  30.33 
 
 		 583 aa  42.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  26.02 
 
 		 335 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>