45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3344 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  100 
 
 
514 aa  1011    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  41.2 
 
 
545 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  40.45 
 
 
543 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  25.53 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  28.57 
 
 
357 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  28.33 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  25.37 
 
 
335 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0845  hypothetical protein  35.62 
 
 
314 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261015  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.25 
 
 
192 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  22.61 
 
 
390 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.56 
 
 
200 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  29.29 
 
 
173 aa  57.4  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  24.04 
 
 
348 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  33.08 
 
 
190 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  36.52 
 
 
1261 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  71.74 
 
 
445 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  28.69 
 
 
397 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  50.77 
 
 
551 aa  53.5  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  31.75 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  33.62 
 
 
239 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  38.75 
 
 
288 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  26.02 
 
 
165 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  27.94 
 
 
465 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  33.93 
 
 
197 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  25.17 
 
 
349 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  28.18 
 
 
205 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  24.54 
 
 
349 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  24.83 
 
 
349 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  24.54 
 
 
349 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  53.19 
 
 
5993 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  32.31 
 
 
195 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.12 
 
 
261 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  24.83 
 
 
349 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  74.29 
 
 
764 aa  47.4  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  24.83 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  24.54 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  24.83 
 
 
349 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  24.8 
 
 
190 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  24.83 
 
 
349 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  24.83 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  41.43 
 
 
555 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  30.69 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  36.84 
 
 
499 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  26.98 
 
 
195 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  63.64 
 
 
854 aa  43.9  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>