43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2081 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  610  1e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0518  hypothetical protein  30.23 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  39.42 
 
 
600 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  42 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  40.23 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0808  lipoprotein LpqB  31.03 
 
 
204 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  33.06 
 
 
545 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  31.75 
 
 
288 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2312  hypothetical protein  30.82 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  31.75 
 
 
514 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  30.88 
 
 
358 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  35.58 
 
 
205 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  30.77 
 
 
543 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  27.45 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  26.39 
 
 
232 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  31.46 
 
 
184 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  29.45 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  32.32 
 
 
174 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  27.33 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  27.33 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  27.45 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  27.27 
 
 
349 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  27.27 
 
 
349 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  26.71 
 
 
349 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  26.71 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  37.35 
 
 
465 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  32.52 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  30.34 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  25.17 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  26.71 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  34.83 
 
 
195 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  31.68 
 
 
484 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  24.82 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  40.51 
 
 
169 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  26.89 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  24.59 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  24.35 
 
 
173 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.08 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  28.83 
 
 
178 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  36.84 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  25.2 
 
 
177 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  30.12 
 
 
202 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>