50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0447 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  100 
 
 		 195 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  32.99 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  29.86 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  32.47 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  29.84 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  31.54 
 
 		 484 aa  67.8  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  30.47 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  28.57 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  32.81 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  31.5 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  33.6 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  31.5 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  26.43 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  29.93 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.2 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  29.93 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  29.93 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  29.93 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  30.71 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  30.71 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  31.45 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  31.45 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  25.68 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0091  hypothetical protein  31.06 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  26.45 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  28.57 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  32.56 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  31.01 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1545  hypothetical protein  29.1 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.383291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  26.24 
 
 		 397 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  27.56 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  24.32 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  28.06 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  31.9 
 
 		 596 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  33.33 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  27.5 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  25 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  29.9 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  27.82 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  24.24 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.36 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  23.08 
 
 		 335 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  27.86 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  23.24 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  26.98 
 
 		 514 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  25.56 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  24.59 
 
 		 306 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  22.53 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  23.77 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>