34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0261 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  89.84 
 
 		 187 aa  334  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  54.21 
 
 		 190 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  48.19 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  50 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  44.26 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  39.78 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  33.99 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  40.13 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  32.58 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  40.29 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  34.75 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  40.23 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  34.06 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  27.88 
 
 		 465 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  27.89 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  26.67 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  44.12 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  27.4 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  29.32 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  31.01 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  31.54 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  28.47 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  31.47 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  37.21 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  27.35 
 
 		 309 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  35.06 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  34.83 
 
 		 397 aa  48.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.81 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.28 
 
 		 383 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  34.12 
 
 		 335 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  29.67 
 
 		 390 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  29.23 
 
 		 328 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>