29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0548 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  59.36 
 
 		 197 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  51.87 
 
 		 190 aa  187  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  48.19 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  47.34 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  47.43 
 
 		 197 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  43.48 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  34.66 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  33.15 
 
 		 173 aa  92.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  33.14 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  37.97 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  35.97 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  27.6 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  37.78 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  32.62 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  31.18 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  29.12 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  27.08 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  24.82 
 
 		 465 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  24.24 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  31.69 
 
 		 288 aa  48.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  28.97 
 
 		 245 aa  48.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.71 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  28.37 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  30.97 
 
 		 397 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  30.65 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0178  hypothetical protein  27.71 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0180  hypothetical protein  27.71 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  31.09 
 
 		 328 aa  41.6  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>