39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1956 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  37.23 
 
 		 465 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  37.24 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  35.04 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  34.48 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  32.41 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  35.71 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  29.08 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  28.36 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  29.53 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  27.08 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  29.41 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  41.86 
 
 		 169 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  28.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  23.9 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  30.72 
 
 		 165 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  27.35 
 
 		 202 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  30.56 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  39.47 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  42.67 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  25.19 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  41.33 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  41.33 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  41.33 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  40 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  27.94 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  40 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  40 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  40 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  36.56 
 
 		 357 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  33.02 
 
 		 188 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  25.29 
 
 		 397 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  29.55 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  32.26 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  27.48 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  25 
 
 		 545 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  31.73 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  37.33 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1830  hypothetical protein  25.45 
 
 		 219 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.216519  normal  0.330201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>