26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2833 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  49.49 
 
 
203 aa  197  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  47.43 
 
 
195 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  43.98 
 
 
190 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  45.09 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  39.78 
 
 
202 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  34 
 
 
465 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  35.04 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  32.89 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  32.97 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  29.28 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  34.06 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  29.86 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  32.86 
 
 
299 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  27.78 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  23.9 
 
 
309 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  28.91 
 
 
239 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  27.96 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  27.59 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.66 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1830  hypothetical protein  32.99 
 
 
219 aa  44.7  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.216519  normal  0.330201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  25.79 
 
 
288 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  27.94 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>