32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4407 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  35.35 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  34.27 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  29.84 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  32.61 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  31.28 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  35.83 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  28.35 
 
 		 465 aa  62  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  28.57 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  30.43 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  32.26 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  29.66 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  28.67 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  26.32 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  33.91 
 
 		 514 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  31.54 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  38.03 
 
 		 169 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  33.04 
 
 		 545 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  30.4 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  28.78 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  32.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  28.91 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  29.91 
 
 		 328 aa  48.5  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  32.58 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  28.49 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  32.17 
 
 		 543 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  27.84 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  28.91 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1435  hypothetical protein  29.29 
 
 		 582 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  24.32 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>