33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2922 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  59.36 
 
 		 195 aa  239  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  47.31 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  49.23 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  49.73 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  45.36 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  45.11 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  34.71 
 
 		 173 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  32.46 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  38.1 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  38.58 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  32.57 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  31.75 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  38.1 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  32.17 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  29.32 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  26.95 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  34.11 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  26.9 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  30.4 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.65 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  28 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  27.01 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.37 
 
 		 383 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  27.82 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  32.74 
 
 		 288 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  30 
 
 		 328 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3698  hypothetical protein  28.46 
 
 		 517 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  32.53 
 
 		 397 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  32 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  23.74 
 
 		 184 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  21.43 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>