44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1052 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  26.4 
 
 		 465 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  42.2 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.33 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  35.54 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  36.45 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  31.43 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  31.69 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.09 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  42.05 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  31.62 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  27.83 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.86 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  28.57 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  28.47 
 
 		 545 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  24.87 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  43.48 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  36.84 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  29.53 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1136  hypothetical protein  35.79 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  34.48 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  31.75 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  30.57 
 
 		 190 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 184 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  35.14 
 
 		 187 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0091  hypothetical protein  25.13 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1545  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.383291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  25.95 
 
 		 177 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  28.35 
 
 		 543 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  31.47 
 
 		 202 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  38.75 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  30.56 
 
 		 197 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 184 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  32.41 
 
 		 178 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  28.17 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0450  hypothetical protein  30.93 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  31.69 
 
 		 195 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0786  hypothetical protein  35.16 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0223093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  27.84 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  35.14 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  41.11 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  25.79 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  41.27 
 
 		 397 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3561  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>