38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1550 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  350  5e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  51.7 
 
 
179 aa  185  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  29.2 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0821  hypothetical protein  35.29 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  27.11 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  27.62 
 
 
484 aa  67.8  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  27.04 
 
 
299 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  32.81 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  34.68 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.33 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  26.63 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  29.37 
 
 
239 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  28.32 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  34.11 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  26.96 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  24.43 
 
 
245 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  26.36 
 
 
288 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  29.85 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  30.23 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  30.4 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  25.19 
 
 
309 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  22.86 
 
 
349 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  22.86 
 
 
349 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  22.86 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  30.65 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  28.07 
 
 
195 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  23.57 
 
 
349 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  22.86 
 
 
349 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  22.86 
 
 
349 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  23.53 
 
 
349 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  25.75 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  26.09 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  30.56 
 
 
349 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  33.78 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  23.7 
 
 
349 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  30.56 
 
 
349 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  25.2 
 
 
306 aa  41.2  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>