49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2479 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  100 
 
 
190 aa  378  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  36.72 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  32.35 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  29.24 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  31.11 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  31.65 
 
 
335 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  28.26 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  26.26 
 
 
195 aa  57.8  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  36.36 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  33.08 
 
 
543 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  31.9 
 
 
465 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  37.84 
 
 
397 aa  55.1  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  24.31 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  32.33 
 
 
545 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  27.88 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  37.33 
 
 
390 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0518  hypothetical protein  28.77 
 
 
248 aa  51.6  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  29.01 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  27.32 
 
 
484 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  27.08 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  38.27 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  32.77 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  37.5 
 
 
349 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  29.41 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  32.11 
 
 
349 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  33.03 
 
 
349 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  40.58 
 
 
349 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  29.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  23.21 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  35.06 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0091  hypothetical protein  33 
 
 
302 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  25.82 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  35 
 
 
349 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  35 
 
 
349 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  35 
 
 
349 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  35 
 
 
349 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  35 
 
 
349 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  33.77 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  30.48 
 
 
348 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  30.91 
 
 
358 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  22.7 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  24.8 
 
 
514 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.58 
 
 
357 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  32.86 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  25.13 
 
 
299 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  25.95 
 
 
306 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  24.26 
 
 
232 aa  42  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.81 
 
 
383 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  27.27 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>