48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1351 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  805    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  32.24 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  29.11 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  28.96 
 
 		 335 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  28.19 
 
 		 349 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  27.52 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  27.12 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  27.42 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  27.52 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  27.52 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  27.72 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  27.96 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  27.96 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  27.52 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  26.5 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  27.56 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  25.44 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.33 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  35.83 
 
 		 239 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  33.61 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  37.84 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  29.46 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  32.5 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  28.69 
 
 		 514 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  32.17 
 
 		 169 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  27.54 
 
 		 192 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  30.51 
 
 		 545 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  30.6 
 
 		 232 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  28.06 
 
 		 190 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  30.66 
 
 		 205 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  31.76 
 
 		 184 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0836  hypothetical protein  24.24 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  31.76 
 
 		 184 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  32.56 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  29.2 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  34.83 
 
 		 202 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  34.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  32.52 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  34.57 
 
 		 173 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1545  hypothetical protein  29.17 
 
 		 301 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.383291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  30.97 
 
 		 195 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  25.29 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  33.71 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  28.24 
 
 		 197 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  25.36 
 
 		 178 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3561  hypothetical protein  29.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>