18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1813 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  76.49 
 
 		 543 aa  723    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1067    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  38.9 
 
 		 514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0845  hypothetical protein  43.3 
 
 		 314 aa  123  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.18 
 
 		 192 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  26.77 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  24.72 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.07 
 
 		 2449 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  28.37 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  25.54 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  29.59 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  32.79 
 
 		 299 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  33.04 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  32.03 
 
 		 200 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.58 
 
 		 357 aa  54.3  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  32.43 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  33.04 
 
 		 239 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  43.51 
 
 		 830 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>