42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0187 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  781    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  36 
 
 		 397 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  30.1 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  30 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  22.88 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  22.59 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  24.69 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  31.45 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  22.22 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.35 
 
 		 192 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  22.61 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  21.89 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  21.89 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  23.23 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  21.77 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  21.77 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  23.15 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  21.89 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  31.09 
 
 		 173 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  23.49 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0836  hypothetical protein  24.49 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  23.43 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  27.12 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  31.03 
 
 		 545 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  28.06 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  37.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  29.77 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  37.93 
 
 		 465 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  28.47 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  25.52 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  27.7 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  30.22 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  36.36 
 
 		 205 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  24.62 
 
 		 165 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  27.69 
 
 		 484 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 184 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  26.97 
 
 		 184 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  37.21 
 
 		 197 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  33.78 
 
 		 177 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  29.67 
 
 		 202 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3561  hypothetical protein  29.1 
 
 		 301 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>