27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2931 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  100 
 
 		 184 aa  358  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  97.83 
 
 		 184 aa  351  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.23 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.64 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  27.42 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  31.03 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  31.58 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  32.46 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  30.41 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  27.75 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  34.57 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  26.34 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  28.47 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  29.32 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  29 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  25.13 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  30.95 
 
 		 335 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  27.36 
 
 		 328 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  31.76 
 
 		 397 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 		 383 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  36.14 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  30.77 
 
 		 288 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  25.47 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  30.34 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  26.97 
 
 		 390 aa  44.7  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  28.28 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>