46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1954 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  30.27 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  28.88 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  28.96 
 
 		 397 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  26.76 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  26.76 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  27.51 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  27.51 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  27.51 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  26.96 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  25.94 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  26.92 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  26.38 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  27.49 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  26.38 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  27.84 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  30.81 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  26.69 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  31.65 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  24.72 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  24.9 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.61 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  23.53 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  23.08 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  32.14 
 
 		 184 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  40.74 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  27.21 
 
 		 173 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  26.21 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  30.95 
 
 		 184 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  29.45 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  23.71 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  41.11 
 
 		 288 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  26.72 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  29.85 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  29.31 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  40.58 
 
 		 174 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2097  hypothetical protein  26.04 
 
 		 202 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  24.18 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0091  hypothetical protein  38.33 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  26.04 
 
 		 202 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4283  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  28.07 
 
 		 575 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  30.59 
 
 		 187 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  27.48 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  34.12 
 
 		 202 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  24.27 
 
 		 245 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1242  lipoprotein LpqB  30.34 
 
 		 586 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.961834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>