44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2284 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  100 
 
 
174 aa  338  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  33.88 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  35.67 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  34.78 
 
 
192 aa  84.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  30.35 
 
 
205 aa  72  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  29.57 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  28.57 
 
 
288 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  26.98 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  35.35 
 
 
328 aa  62  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  32 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  27.74 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  31.62 
 
 
465 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  29.73 
 
 
306 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  25 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  24.57 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.28 
 
 
600 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  23.7 
 
 
484 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  28.92 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  28.91 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  26.02 
 
 
514 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  36.36 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  24.44 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  21.21 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0808  lipoprotein LpqB  29.27 
 
 
204 aa  47.8  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  29.63 
 
 
309 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  27.84 
 
 
335 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  23.16 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  27.07 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  40.3 
 
 
349 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  29.46 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  25.54 
 
 
299 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  24.47 
 
 
349 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  23.3 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  27.03 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  31.82 
 
 
349 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  40.3 
 
 
349 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  24.47 
 
 
349 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  24.47 
 
 
349 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  23.94 
 
 
349 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  23.94 
 
 
349 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  25.28 
 
 
349 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  33.33 
 
 
349 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  26.06 
 
 
178 aa  41.2  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  25.93 
 
 
227 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>