17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0189 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2097  hypothetical protein  43.61 
 
 
202 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  43.17 
 
 
202 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  40.61 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2312  hypothetical protein  44.5 
 
 
204 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0808  lipoprotein LpqB  46.63 
 
 
204 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  42.69 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  27.03 
 
 
465 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  27.4 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.26 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.13 
 
 
600 aa  49.3  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  36.84 
 
 
328 aa  48.5  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  29.73 
 
 
165 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  31.86 
 
 
178 aa  45.1  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0518  hypothetical protein  24.2 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  33.7 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  29.03 
 
 
288 aa  42.4  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>