35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2736 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  38.81 
 
 
465 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  35.04 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  32.97 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  34.07 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  32.92 
 
 
197 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  32.37 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  24.7 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  32.17 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  31.25 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.07 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  27.49 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  34.62 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  31.18 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  32.14 
 
 
397 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  26.43 
 
 
195 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  32.32 
 
 
299 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  31.85 
 
 
288 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  26.32 
 
 
239 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  27.4 
 
 
202 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  26.9 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  37.97 
 
 
328 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  26.5 
 
 
514 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  24.26 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  30.72 
 
 
309 aa  50.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  30.4 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  29.73 
 
 
227 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  30.65 
 
 
390 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  27.7 
 
 
203 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  24.72 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  24.43 
 
 
335 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2312  hypothetical protein  34.48 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2162  hypothetical protein  26.8 
 
 
288 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  32 
 
 
600 aa  40.8  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  26.32 
 
 
245 aa  40.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>