15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2312 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2312  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0808  lipoprotein LpqB  72.68 
 
 
204 aa  270  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2097  hypothetical protein  39.23 
 
 
202 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  39.23 
 
 
202 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  41.87 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  38.2 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  41.1 
 
 
227 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  31.91 
 
 
306 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  33.33 
 
 
600 aa  53.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  37.5 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  25.9 
 
 
465 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  26.23 
 
 
484 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  33.64 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  33.59 
 
 
328 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  34.48 
 
 
165 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>