17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2097 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2097  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  96.53 
 
 
202 aa  396  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  43.61 
 
 
227 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  42.93 
 
 
197 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0808  lipoprotein LpqB  45.39 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2312  hypothetical protein  46.36 
 
 
204 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1316  hypothetical protein  44.93 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.930017  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  31.75 
 
 
465 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  28.66 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.03 
 
 
600 aa  49.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  31.4 
 
 
178 aa  48.9  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  27.21 
 
 
484 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3561  hypothetical protein  28.12 
 
 
301 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  28.68 
 
 
328 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  29.23 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  30.85 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  26.28 
 
 
335 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>