17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0449 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  352  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3561  hypothetical protein  39.36 
 
 
301 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  33.61 
 
 
197 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  32.41 
 
 
288 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2141  putative spore germination protein  30.83 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2097  hypothetical protein  30.83 
 
 
202 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  40.21 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  25.52 
 
 
390 aa  47.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  28.76 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0189  hypothetical protein  31.86 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.48473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  30.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  25.17 
 
 
397 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0808  lipoprotein LpqB  28.99 
 
 
204 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  32.26 
 
 
465 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  28.1 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  28.83 
 
 
306 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.03 
 
 
600 aa  41.2  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>