33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0276 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  89.84 
 
 		 202 aa  334  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  52.11 
 
 		 190 aa  197  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  47.34 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  50.61 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  43.17 
 
 		 203 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  38.85 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  34.3 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  28.98 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  34.63 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  41.38 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  32.85 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  32.12 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  27.75 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  28.67 
 
 		 465 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  27.49 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  29.47 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  32 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  30.66 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  32.56 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  35.14 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  28.49 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  33.77 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  33.71 
 
 		 397 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.29 
 
 		 383 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  30 
 
 		 328 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  30.59 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.7 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  30.53 
 
 		 390 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0449  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  42  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>