22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2050 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  100 
 
 
179 aa  359  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  50.64 
 
 
177 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  27.91 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0821  hypothetical protein  39.84 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  24.68 
 
 
465 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  28.12 
 
 
205 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  32.26 
 
 
239 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  29.86 
 
 
288 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  30.89 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  31.78 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  22.67 
 
 
299 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  33.85 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  24.03 
 
 
484 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  31.36 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  30.47 
 
 
190 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  30.81 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  30.71 
 
 
195 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  26.71 
 
 
328 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  30.66 
 
 
197 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  29.41 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  21.84 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>