21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1412 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  49.49 
 
 
197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  43.48 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  46.39 
 
 
197 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  42.7 
 
 
190 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  44.26 
 
 
202 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  43.17 
 
 
187 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  36.04 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  32.61 
 
 
465 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.77 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  33.12 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  32.47 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  27.91 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  37.5 
 
 
299 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  37.23 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  33.06 
 
 
245 aa  55.1  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  34.12 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  29.14 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  29.41 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  28.06 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  27.7 
 
 
165 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>