32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4587 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  100 
 
 
349 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  98.57 
 
 
349 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  95.99 
 
 
349 aa  685    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  95.7 
 
 
349 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  99.14 
 
 
349 aa  701    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  89.97 
 
 
349 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  98.57 
 
 
349 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  98.85 
 
 
349 aa  698    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  98.85 
 
 
349 aa  698    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  98.57 
 
 
349 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  78.22 
 
 
348 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  53.06 
 
 
357 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  52.23 
 
 
358 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  27.36 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  27.76 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  33.9 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  25.29 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  31.5 
 
 
195 aa  63.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  22.34 
 
 
390 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  30.3 
 
 
245 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  28.57 
 
 
545 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  27.56 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  30.25 
 
 
596 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  37.5 
 
 
190 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  37.37 
 
 
173 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  26.71 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  41.33 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  24.83 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  22.86 
 
 
177 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  36.76 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  40.3 
 
 
174 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  27.56 
 
 
192 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>