30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2606 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1065    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  77.26 
 
 		 545 aa  752    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  37.26 
 
 		 514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0845  hypothetical protein  45.52 
 
 		 314 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  29.63 
 
 		 192 aa  67  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  26.64 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  23.53 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  30.19 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  28.24 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  27.39 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  32.03 
 
 		 200 aa  57  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  33.08 
 
 		 190 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.43 
 
 		 2449 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  28 
 
 		 349 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  27.88 
 
 		 349 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  27.56 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  27.56 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  27.56 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  27.56 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  27.56 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  27.88 
 
 		 349 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  31.93 
 
 		 596 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  32.14 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  27.88 
 
 		 349 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  27.24 
 
 		 358 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.3 
 
 		 357 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  32.17 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  27.49 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  42.24 
 
 		 916 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45 
 
 		 830 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>