More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4654 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4654  CheB methylesterase  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054041  hitchhiker  0.000000000000484785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3639  CheB methylesterase  31.67 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.619946  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6403  CheB methylesterase  30 
 
 
203 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00116583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.89 
 
 
1371 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.75 
 
 
1380 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.42 
 
 
1361 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2649  CheB methylesterase  30.77 
 
 
195 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115234  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  27.22 
 
 
1200 aa  98.6  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  29.84 
 
 
1384 aa  97.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5191  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  33.15 
 
 
813 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  29.78 
 
 
1337 aa  95.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  34.1 
 
 
432 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 
1008 aa  94.4  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.57 
 
 
1138 aa  94  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  27.87 
 
 
1027 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.89 
 
 
993 aa  92.8  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  28.96 
 
 
980 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.96 
 
 
1190 aa  92  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  29.44 
 
 
879 aa  90.9  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.51 
 
 
1407 aa  90.5  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  32.24 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.62 
 
 
1274 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.18 
 
 
887 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  26.63 
 
 
1160 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6342  CheB methylesterase  26.34 
 
 
336 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.59 
 
 
1759 aa  87.8  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  30.81 
 
 
351 aa  87.8  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  27.87 
 
 
1399 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.12 
 
 
1000 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  26.11 
 
 
998 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
1279 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  27.47 
 
 
820 aa  86.3  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.63 
 
 
1306 aa  85.1  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.47 
 
 
1499 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.44 
 
 
1120 aa  84.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.78 
 
 
971 aa  84.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  28.34 
 
 
212 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.33 
 
 
1453 aa  84.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  26.11 
 
 
877 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.98 
 
 
1008 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.69 
 
 
1242 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.68 
 
 
852 aa  82.4  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.42 
 
 
1233 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  26.11 
 
 
868 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.65 
 
 
1408 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5175  MCP methyltransferase, CheR-type  26.78 
 
 
823 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367936 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  30.34 
 
 
1092 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  26.11 
 
 
1167 aa  81.3  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.4 
 
 
1348 aa  81.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  27.65 
 
 
1618 aa  81.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  28.02 
 
 
1006 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.09 
 
 
1535 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  29.66 
 
 
1045 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  23.76 
 
 
1218 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  26.49 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  26.52 
 
 
1483 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  26.26 
 
 
1222 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  28.33 
 
 
338 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  26.4 
 
 
617 aa  78.2  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  25.15 
 
 
1035 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  26.6 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.95 
 
 
1698 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  29.12 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  27.03 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  27.03 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  29.51 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  29.41 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  29.19 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  27.32 
 
 
327 aa  74.7  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  28.33 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.67 
 
 
1445 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1840  MCP methyltransferase, CheR-type  24.58 
 
 
840 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3128  MCP methyltransferase, CheR-type  24.58 
 
 
840 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  26.21 
 
 
1010 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  26.71 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  28.42 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4160  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.34 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  26.09 
 
 
1149 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  28.32 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.92 
 
 
1404 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.86 
 
 
1220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1344 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  27.72 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  28.65 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  28.34 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  29.3 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  28.33 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  25.54 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  27.78 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  26.67 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.89 
 
 
1158 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  25.95 
 
 
329 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.72 
 
 
2468 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.86 
 
 
1214 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  27.5 
 
 
258 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  26.35 
 
 
824 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.37 
 
 
1215 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  27.78 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  30.46 
 
 
853 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  26.34 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>