More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4366 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4366  Pirin domain protein  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0879  Pirin domain protein  47.04 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5419  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176862  normal  0.0468453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3804  Pirin domain protein  40.97 
 
 		 287 aa  225  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  34.17 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  31.97 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  30.94 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  30.74 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  30.35 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  29.96 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  31.45 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  33.46 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  30.19 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  30.07 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  30.07 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  30.07 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  27.4 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  30.34 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  30.34 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.02 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  29.71 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  29.71 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  29.71 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  30.53 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  30.9 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  31.47 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  29.93 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  29.02 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  33.06 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  29.32 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  30.41 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  30.74 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  31.91 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  30.74 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  31.08 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  30.71 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  31.75 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  31.47 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  31.47 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  30.34 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  31.87 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  30.08 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  28.38 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  30.98 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  28.22 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  30.77 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  30.88 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  30.43 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  29.86 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  28.68 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  30.38 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  31.66 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  28.72 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  28.43 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  32.55 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  28.14 
 
 		 346 aa  98.6  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  30.9 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  30.95 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  30.5 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  27.61 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  27.36 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  29.09 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  27.92 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  29.26 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  28.29 
 
 		 290 aa  95.9  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  28.85 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  29.15 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  28.82 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  29.2 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  27.6 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  29.18 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  27.13 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28358  RNA pol II transcription cofactor  32.41 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  28.38 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  27.95 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  27.83 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  29.66 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  26.2 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  28.1 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  27.83 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  27.83 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  27.83 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  27 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  27.83 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  27.91 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  28.19 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  29.49 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  30.12 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  27.65 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  29.84 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  27.03 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  27.65 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  28.23 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  25.18 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  28.33 
 
 		 322 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  25.18 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  28.51 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>