More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5419 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5419  Pirin domain protein  100 
 
 		 316 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176862  normal  0.0468453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0879  Pirin domain protein  59.79 
 
 		 290 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3804  Pirin domain protein  54.86 
 
 		 287 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4366  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  34.16 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  32.72 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  34.02 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.08 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  36.24 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  31.25 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  30.15 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  37.4 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  32.35 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  36.4 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  36.02 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  37.89 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  33.72 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  32.79 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  37.11 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  31.62 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  31.25 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  36.69 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  31.37 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  34.75 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  30.66 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  34.1 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  30.77 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  33.85 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  30.77 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  30.23 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  30.77 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  34.29 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.3 
 
 		 284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  33.6 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  30.88 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  30.88 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  30.4 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  30.4 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  30.4 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  31.94 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  35.15 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  33.21 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  30.45 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  31.1 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  31.98 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  34.89 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  34.38 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  32.1 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  31.06 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  31.92 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  31.4 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  31.42 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  31.54 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  31.4 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  31.4 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  31.54 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  30.36 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  32.45 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  31.82 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  29 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  32.75 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  29.74 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  30.38 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  32.43 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  29.73 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  32.43 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  31.54 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  32.43 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  34.05 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  32.63 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  29.66 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  29.39 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  29.39 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  29.96 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  29.39 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  32.67 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  29.39 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  31.03 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  33.2 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  29.73 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  30.74 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  31.78 
 
 		 286 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  32.95 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  30.89 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  32.91 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  30.68 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  28.81 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  32.26 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  28.91 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  28.42 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  30.35 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  32.96 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  31.15 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  31.82 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  28.02 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>