More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3804 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3804  Pirin domain protein  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5419  Pirin domain protein  54.86 
 
 
316 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176862  normal  0.0468453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0879  Pirin domain protein  55.05 
 
 
290 aa  329  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4366  Pirin domain protein  40.97 
 
 
285 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  35 
 
 
277 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  35.53 
 
 
298 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  35.53 
 
 
298 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  33.46 
 
 
285 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  34.51 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  35.07 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  34.1 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  31.38 
 
 
290 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  35.9 
 
 
298 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  32.94 
 
 
290 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  34.19 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  30.56 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  31.62 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  34.34 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  32.99 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  34.34 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  32.41 
 
 
292 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  36.09 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  32.55 
 
 
290 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  32.55 
 
 
290 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  33.72 
 
 
283 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  32.73 
 
 
307 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  35.45 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  33.57 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  31.37 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  32.3 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  32.3 
 
 
285 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  32.7 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  32.27 
 
 
279 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  31.19 
 
 
290 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  31.19 
 
 
290 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  31.19 
 
 
290 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  31.19 
 
 
290 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  31.19 
 
 
290 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  31.19 
 
 
290 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  31.58 
 
 
285 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  33.71 
 
 
299 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  33.48 
 
 
283 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  32.41 
 
 
292 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  31.27 
 
 
290 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  33.44 
 
 
337 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  30.98 
 
 
293 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  33.98 
 
 
274 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  30.56 
 
 
289 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  29.92 
 
 
289 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  32.6 
 
 
303 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  32.17 
 
 
282 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  30.94 
 
 
286 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  30.56 
 
 
289 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  30.56 
 
 
289 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  31.83 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  30.74 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  33 
 
 
322 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  31.88 
 
 
303 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  32.94 
 
 
296 aa  118  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  31.43 
 
 
301 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  33.2 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  35.06 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  29.35 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  32.03 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  31.25 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  30.8 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  32.09 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.46 
 
 
284 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  34.9 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  31.2 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  31.49 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  31.27 
 
 
303 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  31.34 
 
 
286 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  29.39 
 
 
286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  31.62 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  31.34 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  31.01 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  33.77 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  31.65 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  27.55 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  31.62 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  30.51 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  31.51 
 
 
309 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  30.55 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  31.03 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  27.99 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  30.07 
 
 
286 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  34.65 
 
 
279 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  27.99 
 
 
286 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  27.99 
 
 
286 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  31.4 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  30.77 
 
 
328 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  27.99 
 
 
286 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  30.77 
 
 
328 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  30.77 
 
 
328 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  30.97 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  30.57 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  28.23 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  29.19 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  29.73 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>