More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0879 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0879  Pirin domain protein  100 
 
 
290 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5419  Pirin domain protein  59.79 
 
 
316 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176862  normal  0.0468453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3804  Pirin domain protein  55.05 
 
 
287 aa  329  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4366  Pirin domain protein  46.69 
 
 
285 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  36.25 
 
 
277 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  33.44 
 
 
318 aa  142  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  33.98 
 
 
290 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  33.59 
 
 
286 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  34.38 
 
 
283 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  33.72 
 
 
292 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.98 
 
 
310 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  32.09 
 
 
290 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  32.58 
 
 
290 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  32.7 
 
 
290 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  33.33 
 
 
337 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  32.7 
 
 
290 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  32.58 
 
 
290 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  32.58 
 
 
290 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  32.7 
 
 
290 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  35 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  35.91 
 
 
298 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  32.43 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  35.29 
 
 
298 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  32.82 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  31.82 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  33.6 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  33.33 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  34.63 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  34.31 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  31.78 
 
 
290 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  31.62 
 
 
331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  33.98 
 
 
292 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  33.47 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  32.53 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  32.43 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  32.43 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  32.43 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.65 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  32.13 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  31.35 
 
 
283 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  30.74 
 
 
286 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  33.47 
 
 
299 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  31.97 
 
 
303 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  31.64 
 
 
282 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  34.25 
 
 
284 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  32.66 
 
 
283 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  32.93 
 
 
290 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  32.93 
 
 
290 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  34.13 
 
 
285 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  35.34 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  31.38 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  32.93 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  31.01 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  32.3 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  33.22 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  31.27 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  33.07 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  30.28 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  33.07 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  30.48 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  31.08 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  31.91 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  29.96 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  28.87 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  31.9 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  28.76 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  30.27 
 
 
288 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  32.35 
 
 
286 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  31.05 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  29.79 
 
 
315 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  31.27 
 
 
289 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  32.26 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  34.82 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  30.89 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  30.86 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  30.15 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  33.2 
 
 
310 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  29.46 
 
 
280 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  29.21 
 
 
312 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  29.51 
 
 
328 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  29.39 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  28.9 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  29.39 
 
 
309 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  28.76 
 
 
293 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  28.38 
 
 
288 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  28.63 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  28.63 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  28.63 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  29.69 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  31.15 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  28.82 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  29.06 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  28.76 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  30.99 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  30.28 
 
 
304 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  29.87 
 
 
290 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  29.17 
 
 
301 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  30.3 
 
 
285 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  31.18 
 
 
302 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  31.84 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>