124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2371 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0436  transposase  72.12 
 
 		 513 aa  775    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  76.8 
 
 		 508 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  99.41 
 
 		 511 aa  1061    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 511 aa  1068    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  77.2 
 
 		 508 aa  790    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  33.59 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  32.62 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  32.41 
 
 		 522 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  34.86 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  34.86 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  34.86 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  31.01 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2023  hypothetical protein  52.98 
 
 		 174 aa  150  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0262122 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  28.14 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  29.78 
 
 		 559 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 		 562 aa  130  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  28.79 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  26.62 
 
 		 562 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  28.07 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.75 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  27.75 
 
 		 563 aa  120  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  27.82 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  26.65 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  26.65 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  26.99 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  29.62 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  29.77 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  29.77 
 
 		 548 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  26.91 
 
 		 562 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  26.43 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  26.43 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  26.12 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  29.28 
 
 		 578 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  26.91 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  25.13 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  29.01 
 
 		 578 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  28.25 
 
 		 578 aa  101  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  25.53 
 
 		 548 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  25.53 
 
 		 548 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  25.53 
 
 		 548 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  27.74 
 
 		 558 aa  100  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  27.13 
 
 		 558 aa  97.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 		 596 aa  97.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  27.81 
 
 		 579 aa  97.8  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  29.22 
 
 		 580 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 		 596 aa  97.1  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  23.34 
 
 		 586 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  23.34 
 
 		 586 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  23.34 
 
 		 586 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  23.34 
 
 		 586 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  23.34 
 
 		 586 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  23.39 
 
 		 596 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  23.82 
 
 		 570 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  23.82 
 
 		 570 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  32.29 
 
 		 275 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  23.68 
 
 		 596 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  25.89 
 
 		 548 aa  87.4  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  24.5 
 
 		 594 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  27.2 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  27.2 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  21.95 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  25.42 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  26.19 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  25.85 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  25.83 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  25.43 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  33.8 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  41.54 
 
 		 275 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  36.36 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  38.36 
 
 		 171 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0559  transposase  45.83 
 
 		 100 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  37.88 
 
 		 130 aa  53.5  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  22.61 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  27.73 
 
 		 258 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  22.2 
 
 		 575 aa  51.2  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  22.45 
 
 		 530 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  32.53 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04630  hypothetical protein  29.47 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.27665  hitchhiker  0.000000619926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0468a  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1698  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.358515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>