108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0043 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0436  transposase  66.4 
 
 		 513 aa  703    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 508 aa  1057    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  76.6 
 
 		 511 aa  804    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  76.8 
 
 		 511 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  99.21 
 
 		 508 aa  1047    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  32.95 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  33.14 
 
 		 539 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  36.14 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  36.14 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  36.14 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  33.94 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  30.68 
 
 		 554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2023  hypothetical protein  56.29 
 
 		 174 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0262122 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  28.5 
 
 		 510 aa  136  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  27.98 
 
 		 563 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  28.35 
 
 		 563 aa  124  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  27.67 
 
 		 562 aa  123  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  28.03 
 
 		 559 aa  123  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  27.91 
 
 		 562 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  27.98 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  27.98 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  27.67 
 
 		 526 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  30.39 
 
 		 547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  30.39 
 
 		 548 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  31.27 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 555 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  27.34 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  27.34 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  24.71 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  25.72 
 
 		 548 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  25.72 
 
 		 548 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  25.72 
 
 		 548 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  24.56 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  25.5 
 
 		 594 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  23.93 
 
 		 570 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  23.93 
 
 		 570 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  26.99 
 
 		 558 aa  97.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  28.05 
 
 		 580 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  25.43 
 
 		 561 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  24.11 
 
 		 596 aa  94.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  27.81 
 
 		 558 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  29.06 
 
 		 579 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  29.76 
 
 		 275 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  23.5 
 
 		 642 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  28.76 
 
 		 578 aa  90.1  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  28.76 
 
 		 578 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  28.76 
 
 		 578 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.58 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.58 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  27 
 
 		 566 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  27.46 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  22.95 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  25.32 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  26.2 
 
 		 573 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  26.2 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  23.17 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  43.66 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  24.57 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  29.63 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  29.9 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  34.09 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  34.09 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  34.09 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  34.09 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  34.09 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  32.14 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  22.22 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  36.99 
 
 		 171 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  28.16 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  34.48 
 
 		 402 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  36.54 
 
 		 108 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0559  transposase  36.84 
 
 		 100 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  36.54 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0555  transposase, IS4  36.54 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  36.54 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  36.54 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  36.54 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3134  transposase, IS4  36.54 
 
 		 577 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>