52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0559 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0559  transposase  100 
 
 		 100 aa  196  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  47.42 
 
 		 578 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  47.42 
 
 		 578 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  47.42 
 
 		 578 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  48.61 
 
 		 561 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 586 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 555 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  45.24 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 		 558 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  49.38 
 
 		 540 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  45.83 
 
 		 511 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  45.83 
 
 		 511 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  38.46 
 
 		 562 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  37.78 
 
 		 548 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  37.78 
 
 		 548 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  37.78 
 
 		 548 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  40.66 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  64.71 
 
 		 562 aa  50.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  36.84 
 
 		 508 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  36.84 
 
 		 508 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  40.66 
 
 		 594 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  61.76 
 
 		 562 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  61.76 
 
 		 562 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  41.43 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 		 566 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  32.73 
 
 		 513 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  48.78 
 
 		 596 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  31.73 
 
 		 632 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  57.45 
 
 		 579 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  60 
 
 		 580 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  39.53 
 
 		 570 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  39.53 
 
 		 570 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  27.06 
 
 		 566 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  51.61 
 
 		 526 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  51.61 
 
 		 532 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  48.48 
 
 		 563 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  51.61 
 
 		 532 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  48.48 
 
 		 509 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  48.48 
 
 		 487 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  48.48 
 
 		 563 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>