93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1901 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  54.45 
 
 		 575 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  100 
 
 		 586 aa  1226    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  26.79 
 
 		 570 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  26.79 
 
 		 570 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  26.79 
 
 		 570 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  26.79 
 
 		 570 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  26.79 
 
 		 570 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3734  hypothetical protein  89.47 
 
 		 100 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1977  transposase  24.29 
 
 		 555 aa  140  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000110578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  21.93 
 
 		 562 aa  99.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  21.53 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  21.32 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  21.57 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  22.72 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  25.09 
 
 		 558 aa  70.5  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4150  hypothetical protein  46.27 
 
 		 123 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  25.1 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  20.5 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  20.5 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  20.5 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  20.5 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  20.5 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  19.56 
 
 		 562 aa  67  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  25.65 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  22.43 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 		 540 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  24.89 
 
 		 540 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  25.43 
 
 		 586 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  24.11 
 
 		 566 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  23.99 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  22.33 
 
 		 596 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  25.45 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  25.45 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  21.08 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  21.08 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  21.08 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  25.45 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  23.69 
 
 		 548 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  23.77 
 
 		 547 aa  56.6  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  23.66 
 
 		 587 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  23.66 
 
 		 587 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 		 520 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 		 520 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 		 520 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2142  transposase IS4 family protein  24.03 
 
 		 520 aa  55.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  21.3 
 
 		 538 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  21.3 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  21.3 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  21.3 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  21.3 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  21.3 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  24.06 
 
 		 563 aa  53.9  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  21.26 
 
 		 559 aa  53.5  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  24.3 
 
 		 449 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  23.72 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  31.06 
 
 		 548 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  22.82 
 
 		 511 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  22.61 
 
 		 511 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  21.44 
 
 		 642 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  25.15 
 
 		 509 aa  51.2  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  22.91 
 
 		 629 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  22.59 
 
 		 573 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3860  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  50.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.690375  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  23.44 
 
 		 561 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  22.59 
 
 		 573 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  24.4 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  23.47 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  20.87 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  21.89 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  21.89 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  25.46 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  23.83 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  23.83 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  23.19 
 
 		 531 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  23.19 
 
 		 531 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  24.61 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  24.53 
 
 		 526 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  22.62 
 
 		 414 aa  44.3  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>