113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1666 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 548 aa  1124    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  98.54 
 
 		 548 aa  1110    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  34.52 
 
 		 563 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  34.71 
 
 		 563 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  33.12 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  33.12 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  33.68 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  34.38 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  33.67 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  26.62 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  26.62 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  26.62 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  26.62 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  26.62 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 596 aa  163  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 596 aa  163  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 596 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  28.49 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  28.49 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  27.07 
 
 		 526 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 		 538 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 		 538 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 		 538 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 		 538 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  38.1 
 
 		 293 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  25.53 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  25.53 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  26.87 
 
 		 548 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  26.87 
 
 		 548 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  26.87 
 
 		 548 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  23.81 
 
 		 562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  25.9 
 
 		 559 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  24.17 
 
 		 548 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  24.21 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  22.89 
 
 		 562 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  22.89 
 
 		 562 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  27.86 
 
 		 579 aa  100  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  23.47 
 
 		 562 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  22.48 
 
 		 566 aa  97.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  23.52 
 
 		 594 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  31.58 
 
 		 558 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  27.54 
 
 		 558 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  24.48 
 
 		 414 aa  93.2  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  28.47 
 
 		 508 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  25.97 
 
 		 539 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  23.9 
 
 		 545 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  23.9 
 
 		 545 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  23.9 
 
 		 545 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  23.9 
 
 		 545 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  23.9 
 
 		 545 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  26.17 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  31.14 
 
 		 578 aa  87.8  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  25.89 
 
 		 511 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  24.7 
 
 		 642 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  30.84 
 
 		 578 aa  87  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  24.39 
 
 		 513 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  30.99 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  27.46 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  25.37 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  25.49 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  25.55 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  25.55 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  26 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  26.34 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  25.96 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  23.96 
 
 		 561 aa  80.1  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  22.34 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  26.71 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  24.85 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  19.69 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  19.69 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  23.32 
 
 		 537 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  23.32 
 
 		 537 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  24.17 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  24.32 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  24.32 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  24.32 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  24.17 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  24.17 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  24.17 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  24.32 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  27.89 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  21.38 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  32.37 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  22.38 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  22.38 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  31.07 
 
 		 402 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  27.64 
 
 		 130 aa  47.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  30.39 
 
 		 171 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  30.1 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0454  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  29.33 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1507  hypothetical protein  36.36 
 
 		 209 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.537606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  21.27 
 
 		 538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  21.27 
 
 		 538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  21.27 
 
 		 538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  21.27 
 
 		 538 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>