188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1129 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  85.92 
 
 
562 aa  977    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  99.47 
 
 
562 aa  1125    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
562 aa  1130    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  68.27 
 
 
562 aa  792    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  56.81 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  56.81 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  56.81 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  52.6 
 
 
594 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  50.62 
 
 
566 aa  538  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
538 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
538 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
538 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
538 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  32.51 
 
 
596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  32.51 
 
 
596 aa  226  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  32.33 
 
 
596 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  29.93 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  29.93 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  29.58 
 
 
526 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0416  hypothetical protein  66.67 
 
 
196 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.607955  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  31.7 
 
 
559 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 
561 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  31.51 
 
 
555 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  31.25 
 
 
586 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  31 
 
 
540 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  31 
 
 
540 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  29.09 
 
 
547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  29.09 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  28.76 
 
 
578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  28.93 
 
 
578 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  28.93 
 
 
578 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  29.72 
 
 
579 aa  157  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  27.42 
 
 
642 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  27.95 
 
 
566 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  29.33 
 
 
558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 
558 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  24.32 
 
 
587 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  24.32 
 
 
587 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  23.82 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  23.82 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  23.82 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  23.82 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  23.82 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  25.88 
 
 
554 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4134  hypothetical protein  47.7 
 
 
182 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  64.15 
 
 
108 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  26 
 
 
563 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  26.23 
 
 
563 aa  140  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  26.98 
 
 
510 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  30.32 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  29.02 
 
 
511 aa  134  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
511 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  28.37 
 
 
573 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  28.17 
 
 
573 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  26.76 
 
 
509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  27.18 
 
 
580 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  25.29 
 
 
487 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 
508 aa  123  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 
508 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  26.19 
 
 
513 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  23.54 
 
 
570 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  23.54 
 
 
570 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  28.42 
 
 
539 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  33.19 
 
 
449 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  26.5 
 
 
632 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  26.97 
 
 
275 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  23.52 
 
 
548 aa  97.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  23.41 
 
 
548 aa  95.9  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  26.89 
 
 
504 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25840  hypothetical protein  26.79 
 
 
565 aa  90.5  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 
504 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 
504 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  26.65 
 
 
545 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  26.65 
 
 
545 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  26.65 
 
 
545 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  26.65 
 
 
545 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  26.65 
 
 
545 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  23.37 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  23.37 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  23.37 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  27.93 
 
 
596 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  23.37 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  23.37 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  29.09 
 
 
359 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 
629 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  24.6 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  28.67 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  23.83 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  23.83 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0479  hypothetical protein  64.29 
 
 
85 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  21.68 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  22.59 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  22.59 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>