173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2970 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  85.54 
 
 		 548 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 594 aa  1192    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  85.54 
 
 		 548 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  85.54 
 
 		 548 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  52.6 
 
 		 562 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  52.77 
 
 		 562 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  51.21 
 
 		 562 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  50.52 
 
 		 562 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  49.66 
 
 		 566 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4134  hypothetical protein  72.6 
 
 		 182 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  98.15 
 
 		 108 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  31.81 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  31.81 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  31.81 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  31.81 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  26.89 
 
 		 596 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  26.89 
 
 		 596 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  30.49 
 
 		 561 aa  171  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 		 596 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  29.59 
 
 		 526 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  27.93 
 
 		 578 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  29.59 
 
 		 532 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  29.59 
 
 		 532 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  27.93 
 
 		 578 aa  163  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  27.77 
 
 		 578 aa  162  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  28.05 
 
 		 563 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  27.84 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  27.48 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  29.14 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  27.38 
 
 		 558 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  28.52 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  27.05 
 
 		 558 aa  143  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0416  hypothetical protein  49.34 
 
 		 196 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.607955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  26.76 
 
 		 555 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  27.92 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 540 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  26.59 
 
 		 586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  26.99 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  27.96 
 
 		 487 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  27.26 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  25.74 
 
 		 548 aa  125  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  27.47 
 
 		 580 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  22.01 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  22.01 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  25.05 
 
 		 554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  22.01 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  22.01 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  22.01 
 
 		 586 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  25.54 
 
 		 642 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  24.35 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.37 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.37 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  24.23 
 
 		 510 aa  114  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0479  hypothetical protein  89.29 
 
 		 85 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal  0.139101 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  26.1 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  25.5 
 
 		 508 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  25.5 
 
 		 508 aa  98.2  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  24.66 
 
 		 548 aa  97.8  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  23.05 
 
 		 570 aa  97.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  23.05 
 
 		 570 aa  97.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  24.27 
 
 		 548 aa  97.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  29.07 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  29.07 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  29.07 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  29.07 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  29.07 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  24.75 
 
 		 511 aa  88.2  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  25 
 
 		 275 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  24.11 
 
 		 604 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  25.7 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  23.67 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  23.67 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  23.03 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  23.67 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  23.03 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  23.03 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  23.67 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  23.67 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  23.45 
 
 		 545 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  27.96 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25840  hypothetical protein  24.2 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  22.5 
 
 		 604 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  23.28 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  22.66 
 
 		 604 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  22.66 
 
 		 604 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  23.88 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  23.82 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3064  hypothetical protein  68.75 
 
 		 81 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2444  hypothetical protein  37.19 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.393197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>