128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1460 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  100 
 
 
642 aa  1315    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 
538 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 
538 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 
538 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  30.16 
 
 
538 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  26.22 
 
 
562 aa  165  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  28.39 
 
 
632 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  27.42 
 
 
562 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  27.42 
 
 
562 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  27.56 
 
 
629 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  28.24 
 
 
578 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  28.08 
 
 
578 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  28.08 
 
 
578 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 
596 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 
596 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 
596 aa  152  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  24.83 
 
 
562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  28.81 
 
 
558 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  25.83 
 
 
555 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  27.48 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  27.48 
 
 
540 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  25.46 
 
 
586 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  28.98 
 
 
579 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  28.76 
 
 
558 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  24.15 
 
 
561 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  28.25 
 
 
509 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  25 
 
 
526 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  28.25 
 
 
563 aa  134  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  24.55 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  24.55 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  28.36 
 
 
563 aa  130  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  28.75 
 
 
487 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  24.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  24.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 
559 aa  125  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  25.27 
 
 
548 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  25.27 
 
 
548 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  25.27 
 
 
548 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  25.45 
 
 
594 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  26.59 
 
 
580 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  21.16 
 
 
586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  21.16 
 
 
586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  21.16 
 
 
586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  21.16 
 
 
586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  21.16 
 
 
586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  23.46 
 
 
566 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  24.33 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  27.86 
 
 
548 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  27.86 
 
 
547 aa  108  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  27.57 
 
 
414 aa  108  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 
511 aa  107  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  25.13 
 
 
511 aa  104  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  24.12 
 
 
554 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  39.46 
 
 
171 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  23.91 
 
 
508 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
596 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  23.5 
 
 
508 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  21.99 
 
 
510 aa  93.2  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  24.7 
 
 
548 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 
573 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  24.33 
 
 
573 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  24.52 
 
 
548 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  28.53 
 
 
449 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1745  transposase  22.37 
 
 
570 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2238  transposase  22.37 
 
 
570 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  22.06 
 
 
570 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  22.06 
 
 
570 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  22.06 
 
 
570 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  25.72 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  22.06 
 
 
570 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  22.06 
 
 
570 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  22.08 
 
 
513 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  24.81 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5702  transposase  28.72 
 
 
293 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.558678 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  26.61 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  25 
 
 
504 aa  72  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  25 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  25 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  34.51 
 
 
574 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  22.93 
 
 
534 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  34.51 
 
 
574 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  22.27 
 
 
537 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  22.27 
 
 
537 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  23.41 
 
 
530 aa  57.4  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  21.44 
 
 
586 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  22.98 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2660  transposase  31.82 
 
 
275 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.951486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  22.22 
 
 
536 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>